有的化肥价格由国务院定价，有的则由市场自主定价。

因为国务院会根据国家经济发展的需要、农业生产的情况、环保政策等因素考虑，制定化肥价格的政策和措施，以调控市场供需和促进农业发展。

但同时，也存在着一些化肥企业和生产商自主定价的情况，这个价格通常受到市场竞争、成本和利润等因素影响。

需要注意的是，即使由国务院定价的化肥，也会有一些地区和时间上的调整，因此具体的化肥价格需要结合当地的实际情况来考虑。