劳务公司走农民工专户做账方法如下：

当建筑企业总承包方认证抵扣增值税专用发票时，会计核算为借：应交税费--应交增值税（进项税额），贷：应交税费--应交增值税（待认证抵扣进项税额）（（支付分包方部分劳务款或工程进度款+通过农民工工资专户代发农民工工资）÷（1+9%）×9%）。

劳务公司或建筑专业分包方C的会计核算为借：银行存款--收到总承包方支付的部分劳务款或工程进度款，应付账款--通过总包代付农民工工资，贷：工程结算（收到总承包方支付的部分劳务款或工程进度款+通过总包代付农民工工资）÷（1+9%），应交税费--应交增值税（销项税额）（（收到总承包方支付的部分劳务款或工程进度款+通过总包代付农民工工资）÷（1+9%）×9%）。